Samer Hussein, Ph.D.

Chercheur régulier
Axe Oncologie, HDQ
Professeur adjoint
Département de biologie moléculaire, de biochimie médicale et de pathologie
Faculté de médecine, Université Laval
 
 
 
 
 

Le Dr Samer Hussein est chercheur au Centre de Recherche du CHU de Québec – Université Laval, dans le groupe St-Patrick de recherche en oncologie fondamentale. Il est également professeur adjoint au département de biologie moléculaire, biochimie médicale et pathologie de la Faculté de médecine, Université Laval.

Ses travaux de recherche visent à comprendre les mécanismes moléculaires qui établissent et régulent les états cellulaires pluripotents, particulièrement le rôle des ARN longs non-codants dans les réseaux géniques, ainsi que les événements transcriptionnels responsables de l’initiation et de la progression du cancer.

Définir les réseaux de gènes et leurs interactions contrôlant les états pluripotents
La pluripotence se définit comme la faculté d’une cellule à générer tous les types cellulaires d’un organisme. Les trois facteurs de transcription Oct4, Sox2, et Nanog représentent les piliers centraux du réseau de régulation des gènes associé au maintien d’un état pluripotent. Grâce à des modèles cellulaires de pluripotence et de reprogrammation ainsi qu’à l’utilisation de technologies à haut débit (protéomique, RNA-seq et ChIP-seq), ce projet a pour but de comprendre comment les interactions entre les facteurs de transcription de pluripotence et les régulateurs de la chromatine déterminent le destin cellulaire et la transition des cellules vers des lignées spécifiques dans le développement embryonnaire ainsi que celui du cancer.

Définir le rôle de certains ARN longs non-codants dans l’identité cellulaire
Les ARN longs non-codants (lncRNA) constituent une classe à part entière d’ARN, caractérisés par le fait qu’ils ne codent pour aucune protéine connue et qu’ils sont composés d’au moins 200 paires de bases. Les lncRNA ont été impliqués dans la régulation génique et le maintien de l’identité cellulaire, mais leur mécanisme d’action impliqué dans l’établissement de la pluripotence demeure inconnu. L’objectif de ce projet est de comprendre le rôle des lncRNAs dans la régulation des états pluripotents et la reprogrammation des cellules souches embryonnaires.

Équipe

Gaëlle Bourriquen, Employé

Victoire Fort, Étudiant 3e cycle

Gaultier Héricher, Étudiant 3e cycle

Gabriel Khelifi, Étudiant 2e cycle

Emeline Lelong, Étudiant 3e cycle

Valérie Watters, Étudiant 2e cycle

Publications

Subramania S, Gagne LM, Campagne S, Fort V, O'Sullivan J, Mocaer K, Feldmuller M, Masson JY, Allain FHT, Hussein SM, Huot MESAM68 interaction with U1A modulates U1 snRNP recruitment and regulates mTor pre-mRNA splicing. Nucleic Acids Res, 47 (8), p. 4181-4197, 2019, ISSN: 0305-1048.

Kim KH, Kim YH, Son JE, Lee JH, Kim S, Choe MS, Moon JH, Zhong J, Fu K, Lenglin F, Yoo JA, Bilan PJ, Klip A, Nagy A, Kim JR, Park JG, Hussein SM, Doh KO, Hui CC, Sung HK. Intermittent fasting promotes adipose thermogenesis and metabolic homeostasis via VEGF-mediated alternative activation of macrophage. Cell Res, 27 (11), p. 1309-1326, 2017, ISSN: 1001-0602.

Kim KH, Rosen A, Hussein SM, Puviindran V, Korogyi AS, Chiarello C, Nagy A, Hui CC, Backx PH. Irx3 is required for postnatal maturation of the mouse ventricular conduction system. Sci Rep, 6, p. 19197, 2016, ISSN: 2045-2322.

Tonge PD, Corso AJ, Monetti C, Hussein SM, Puri MC, Michael IP, Li M, Lee DS, Mar JC, Cloonan N, Wood DL, Gauthier ME, Korn O, Clancy JL, Preiss T, Grimmond SM, Shin JY, Seo JS, Wells CA, Rogers IM, Nagy A. Corrigendum: Divergent reprogramming routes lead to alternative stem-cell states. Nature, 523 (7562), p. 626, 2015, ISSN: 0028-0836.

Hussein SM, Puri MC, Tonge PD, Benevento M, Corso AJ, Clancy JL, Mosbergen R, Li M, Lee DS, Cloonan N, Wood DL, Munoz J, Middleton R, Korn O, Patel HR, White CA, Shin JY, Gauthier ME, Cao KA, Kim JI, Mar JC, Shakiba N, Ritchie W, Rasko JE, Grimmond SM, Zandstra PW, Wells CA, Preiss T, Seo JS, Heck AJ, Rogers IM, Nagy A. Corrigendum: Genome-wide characterization of the routes to pluripotency. Nature, 523 (7562), p. 626, 2015, ISSN: 0028-0836.

Shakiba N, White CA, Lipsitz YY, Yachie-Kinoshita A, Tonge PD, Hussein SM, Puri MC, Elbaz J, Morrissey-Scoot J, Li M, Munoz J, Benevento M, Rogers IM, Hanna JH, Heck AJ, Wollscheid B, Nagy A, Zandstra PWCD24 tracks divergent pluripotent states in mouse and human cells. Nat Commun, 6, p. 7329, 2015, ISSN: 2041-1723.

Hussein SM, Puri MC, Tonge PD, Benevento M, Corso AJ, Clancy JL, Mosbergen R, Li M, Lee DS, Cloonan N, Wood DL, Munoz J, Middleton R, Korn O, Patel HR, White CA, Shin JY, Gauthier ME, Le Cao KA, Kim JI, Mar JC, Shakiba N, Ritchie W, Rasko JE, Grimmond SM, Zandstra PW, Wells CA, Preiss T, Seo JS, Heck AJ, Rogers IM, Nagy A. Genome-wide characterization of the routes to pluripotency. Nature, 516 (7530), p. 198-206, 2014, ISSN: 0028-0836.

Tonge PD, Corso AJ, Monetti C, Hussein SM, Puri MC, Michael IP, Li M, Lee DS, Mar JC, Cloonan N, Wood DL, Gauthier ME, Korn O, Clancy JL, Preiss T, Grimmond SM, Shin JY, Seo JS, Wells CA, Rogers IM, Nagy A. Divergent reprogramming routes lead to alternative stem-cell states. Nature, 516 (7530), p. 192-7, 2014, ISSN: 0028-0836.

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Clancy JL, Patel HR, Hussein SM, Tonge PD, Cloonan N, Corso AJ, Li M, Lee DS, Shin JY, Wong JJ, Bailey CG, Benevento M, Munoz J, Chuah A, Wood D, Rasko JE, Heck AJ, Grimmond SM, Rogers IM, Seo JS, Wells CA, Puri MC, Nagy A, Preiss T. Small RNA changes en route to distinct cellular states of induced pluripotency. Nat Commun, 5, p. 5522, 2014, ISSN: 2041-1723.

Lee DS, Shin JY, Tonge PD, Puri MC, Lee S, Park H, Lee WC, Hussein SM, Bleazard T, Yun JY, Kim J, Li M, Cloonan N, Wood D, Clancy JL, Mosbergen R, Yi JH, Yang KS, Kim H, Rhee H, Wells CA, Preiss T, Grimmond SM, Rogers IM, Nagy A, Seo JS. An epigenomic roadmap to induced pluripotency reveals DNA methylation as a reprogramming modulator. Nat Commun, 5, p. 5619, 2014, ISSN: 2041-1723.

Michael IP, Westenskow PD, Hacibekiroglu S, Greenwald AC, Ballios BG, Kurihara T, Li Z, Warren CM, Zhang P, Aguilar E, Donaldson L, Marchetti V, Baba T, Hussein SM, Sung HK, Iruela-Arispe ML, Rini JM, van der Kooy D, Friedlander M, Nagy A. Local acting Sticky-trap inhibits vascular endothelial growth factor dependent pathological angiogenesis in the eye. EMBO Mol Med, 6 (5), p. 604-23, 2014, ISSN: 1757-4676.

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Hussein SM, Batada NN, Vuoristo S, Ching RW, Autio R, Narva E, Ng S, Sourour M, Hamalainen R, Olsson C, Lundin K, Mikkola M, Trokovic R, Peitz M, Brustle O, Bazett-Jones DP, Alitalo K, Lahesmaa R, Nagy A, Otonkoski T. Copy number variation and selection during reprogramming to pluripotency. Nature, 471 (7336), p. 58-62, 2011, ISSN: 0028-0836.

Rajala K, Lindroos B, Hussein SM, Lappalainen RS, Pekkanen-Mattila M, Inzunza J, Rozell B, Miettinen S, Narkilahti S, Kerkela E, Aalto-Setala K, Otonkoski T, Suuronen R, Hovatta O, Skottman H. A defined and xeno-free culture method enabling the establishment of clinical-grade human embryonic, induced pluripotent and adipose stem cells. PLoS ONE, 5 (4), p. e10246, 2010.

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